在利贝尔整个充满了神秘和恐怖的世界当中，一场扑朔迷离的带有神秘色彩的战斗打响了。玩家可以在英雄传说第六部的空之轨迹SC当中感受到玄幻和刺激，在英雄传说的故事继续到空之轨迹的时候， 艾丝蒂尔虽然经历了许许多多的不幸和风险，但是他仍然坚持到了这一个时代，而一直在前几部的剧情当中和艾丝蒂尔一同作战的约修亚却因为自己的原因，离开了一直以来相处融洽的队友。他们的分开预示着一场充满了神秘力量控制的阴谋即将上演，玩家便是揭开这场大阴谋，拯救整个空间世界的英雄。玩家在这里参与了一场史无前例的空间战斗，许多具有特殊武力的空中武器出现在玩家眼前，控制和利用这些武器就可以让玩家在空战当中取得胜利，并且玩家还可以通过增强自己的武器装备来带到提升技能的目的。
